珍稀濒危动物———茂兰动物中，属国家一级保护动物有云豹、蟒、白颈长尾雉、林麝、中华秋沙鸭5种；二级保护动物有猕猴、黑 熊、穿山甲、白鹇、虎纹蛙等100余种。洞栖和岩栖动物———喀斯特地貌典型发育，林区内洞穴丰富，因而茂兰动物中洞栖和岩栖种类所占比例较大，如翼手目、啮齿目的鼯鼠科等种类。特别是大量洞穴的存在，为诸如蝙蝠、洞穴鱼、洞穴蜘蛛等提供非常好的栖息场所。特有动物———由于特殊的植物多样性、食物链结构、栖息环境等原因，也产生了许多动物新种和特有种。已经发现的茂兰动物特有种有200余种，如荔波壁虎、荔波盲条鳅，长须金线鲃、大鳞金线鲃等，其余的大多均为昆虫和其他无脊椎动物。
