一，属性不同
齐椒为茄科辣椒属植物，花椒为芸香科花椒属于植物。齐椒为一年生或有限多年生草本植物，花椒则为落叶乔木。二者的株植区别明显，齐椒高约40-80厘米，花椒高约7米。
二，花色不同
齐椒的花为灰紫色，花冠白色。花椒的花为黄绿色
